COBALT

Ce calculateur, fourni par BULL, a été installé au CCRT mi 2016. Sa puissance de calcul crête est passée à 2.4 PFlop/s en 2019.

IdentitE

• Marque : ATOS - BULL
• Modele : B700 avec DLC et bullx R421
• Systeme d'exploitation : bullx supercomputer suite 5 (base ReddHat 7)
• Nom : COBALT

Configuration

Le supercalculateur COBALT est un cluster incluant :

39 816 cœurs de calculs et traitements Intel® Xeon® Broadwell, cadencés à 2.4 Ghz :

• 28 cœurs/nœud
• 128 Go de mémoire /nœud

10 080 cœurs de calculs et traitements Intel® Xeon® Skylake, cadencés à 2.4 Ghz :

• 40 cœurs/nœud
• 192 Go de mémoire /nœud

4 nœuds grande mémoire à 3 To/nœud pour France Génomique

18 nœuds hybrides (Intel Broadwell - GPU Nvidia Pascal)

3 nœuds deep learning (Intel Skylake - GPU Nvidia Volta)

 

Les nœuds sont interconnectés par un réseau haute performance InfiniBand EDR.

La capacité de stockage local des données sur COBALT est de 2.5 Po .

Le système est exploité à travers la plate-forme logicielle HPC optimisée bullx supercomputer suite associant en particulier le système d'exploitation Linux^®, plate-forme développée par Bull pour l’administration, l’environnement de développement Intel et le système de fichiers opensource Lustre^®.

Le gestionnaire de batch et de ressources est SLURM^®.

L'environnement de développement comprend notamment les produits suivants:

• Intel Parallel Studio XE : :

  - BLAS et LAPACK dans Intel MKL,
  - ScalaPACK et BLACS dans Intel MKL,
  - GNU Compiler Collection version 4 dans la RHEL7,
  - Les compilateurs C/C++/Fortran optimisés pour le processeur
    dans les produits Intel correspondants.
  
• bullxprof : outil de profiling fournissant une analyse de premier niveau du comportement d’une application.
  
• PAPI : la bibliothèque « Performance API » permet l’accès aux compteurs d’évènements gérés par les composants matériels depuis les applications de plus haut niveau.
  
• Debugger DDT d'Allinéa et Totalview
  
• Librairies MPI: OpenMPI 1.8.x supportant la norme MPI3